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热度 4 岳东晓 2016-9-11 11:21
Broad研究院 张峰与 加州大学(UC)的 DOUDNA 的专利纠纷目前已经进入白热化阶段。根据美国专利局案卷显示,UC 将传关键证人,张峰实验室叛逃者林帅亮作证。 我看之前对这个专利争夺的报道说得不清不楚。我在读了相关法律文件、证词之后,应该说对相关争议已经相当清楚了。现在我简明扼要地科普并介绍案情最新进展。 我先简单介绍一下双方的专利之争及相关背景。2011年 , Deltcheva等人的论文发现细菌 Cas9 免疫系统需要四个部分:Cas9 蛋白,crRNA, tracrRNA 与 RNase III。但这篇论文并没有弄清tracrRNA的具体作用(该文认为 tracrRNA 引导 crRNA 的 maturation)。如下图。 2012年6月,Jinek 与 Doudna 等人的论文宣布,通过在细胞体外的试管实验发现主管DNA切割的充分并且必要的三个部分:Cas9, crRNA 与tracrRNA (不需要 RNase III)。论文还确定了几个部分的作用,其中 Cas9 是切割机, crRNA 的主要作用是定位,而 tracrRNA 是在与crRNA耦合后启动切割 (activate)。而且 Jinek 等还成功把 crRNA 与tracrRNA 连起来成为一个分子,这样可以把 DNA 切割的组件由三个变成两个。如下图:左边是自然原核细菌中的机制,两个RNA分子;右边则是人工机制,把两个RNA给连起来了,成为一个带着一个配对圈的RNA分子。但 Jinek 等人的实验并没有在任何细胞内进行, 只是在细胞体外的试管里, 当然也没有在动植物等真核细胞内实验,也不知道能否可行( “it was not known whether such a bacterial system would function in eukaryotic cells.”) 。在该论文发表后几个月 DOUDNA等人表示在真核细胞的实验遇到了很多困扰("many frustrations")。 ‘ 张峰等人在2013年1月发表论文,表示他们成功使用 CRISPR 技术实现了 对真核细胞的基因编辑。张峰与 DOUDNA都申请了专利。 张峰的专利是:用Cas9 + 两个RNA 或者 一个人工拼接的RNA在真核细胞内进行基因编辑。 DOUDNA的专利申请是:用Cas9 + 一个人工拼接的RNA进行基因编辑。 注意两者的区别:张峰的是两个RNA(crRNA 与 tracrRNA )或者是一个人工合成的RNA,在 真核细胞 进行编辑。DOUDNA 是 用一个人工合成的RNA 对任何基因进行编辑。 另外注意:自然现象是 Cas9 + 两个RNA (crRNA 与 tracrRNA )在原核细胞(如细菌)内进行DNA切割, 自然现象是不能申请专利的 。所以,DOUDNA的是一个人工RNA;张峰则是在真核细胞内。 现在DOUDNA说,张峰的仅仅是把技术扩展到了真核细胞,这是“显然”的事情,张峰的发明是他们的发明的显然应用,构成专利干扰(注一)。张峰则说,他们的研究不是显然,DOUDNA组在真核上实验就遇到了很多问题。这一点上,似乎张峰有力。轮到专利争端了,人家都做出来了,UC再改口说“显然”似乎说服力不大。 正在双方开打之际,张的阵营出现了一个叛逃者,名叫林帅亮,此人是中国农业大学毕业、然后在清华攻读博士,2011年到张峰实验室干了约一年,他在2015年2月28日给 DOUDNA 发去一个邮件,标题是“The Broad CRISPR 专利以及在你的实验室申请工作”,这封邮件中说,张峰是在2012年看到 DOUDNA的论文才开始用CRISPR研究,之前只做老的技术。林帅亮两天后就在UCSF (UC系统的一个分校)拿到了工作。他的这封邮件成了UC(DOUDNA)方面的有力武器。林帅亮投名状如下: 但张峰方面提出了反制证据,早在2012年1月,张峰就提交了一个研究经费申请,这个申请里,张峰根据 Deltcheva 2011年的论文,申请使用 CRISPR 对真核细胞进行基因编辑,而且根据他们的说法,在DOUDNA论文之前,他们就已经使用双 RNA 分子在真核细胞内取得了成功。张峰经费申请相关页面截屏如下(而且张还有实验记录等证据)。 这样看来,证据对张峰相当有利。因此,UC要反击需要林帅亮的强烈证词。现在UC 方面已经申请批准传讯(SUBPOENA) 林帅亮 ( Senior Party (“UC”) requests: (1) leave to issue subpoenas on Drs. Shuailiang Lin and... ),要求他交出他在投名状邮件中提到的种种证据。 根据报道,到目前为止张峰公司 Editas 为了相关专利官司已经花了1000万美金律师费等费用。UC的专家证人包括2009年的诺贝尔生理学奖获得者,双方都是都全力以赴。这个官司的结果决定的将是一个巨大数字的经济利益。 从案子看,随便说话可能带来不利影响。我建议所有想申请生物技术专利的人士读读相关法律文件。 注一:“ An interference exists if the subject matter of a claim of one party would, if prior art, have anticipated or rendered obvious the subject matter of a claim of the opposing party and vice versa." 37 C. F. R. § 41.203(a) A claim is anticipated if each and every limitation is found either expressly or inherently in a single prior art reference. Structural Rubber Prods. Co. v. Park Rubber Co., 749 F.2d 707, 715 (Fed.Cir. 1984). Obviousness factors include (1) the scope and content of the prior art , (2) the level of ordinary skill in the art, (3) differences between the prior art and the claims at issue. Graham v. John Deere Co. of Kansas City, 383 US 1 (1966).
个人分类: 科普|8151 次阅读|3 个评论
分享 对西医的反思与批判
热度 4 稻草 2014-6-17 10:10
  寻找疾病的真正病因   1928年,抗生素诞生了,我们向世人宣称能够控制所有感染性的疾病。但我们没有想到,抗生素会给人类带来一系列疾病。过去,医学人员认为是病毒、细菌制造了疾病。但是现代研究发现,有10%的病人感染依波拉病毒,但并没有死于这种病,原因在于他们身体里有抵抗力;同样,有30%的肺结核病人并没有出现严重的症状,而且还可以自行恢复。科学家认识到,是否患肺结核取决于自身免疫系统;艾滋病,有5%的人感染后5年甚至10年也不发病。在各种宣传资料上,都提到HIV病毒,但我没有在任何的医学报告上看到实验证明是HIV病毒制造的艾滋病。我们所看到的实验报告上是这样写的:所有的艾滋病人体内都有HIV病毒的存在。这两种意思是完全不同的。   我举个通俗的例子:这里有一堆垃圾,有垃圾的地方自然会有苍蝇,但这并不表示说,是苍蝇制造了垃圾。而以前我们认为苍蝇就是病因,然后赶快发明一种化学武器出来,将苍蝇消灭掉;杀死苍蝇以后,垃圾里又跑出蚊子,我们又赶快把蚊子消灭掉;之后,垃圾里又跑出蟑螂,杀死蟑螂,垃圾里又会跑出老鼠,总而言之,是永无止境的。因为真正的原因并不在于苍蝇、蚊子,而在于这堆垃圾。得到健康的关键是要把垃圾消灭掉。所以现在的科学家开始研究基础免疫学。   免疫系统涉及不计其数的细胞、特殊物质及器官之间的高度纷繁复杂的相互作用。它随时处于战备状态,能够预防疾病,并能明确地知道应该什么时候、在哪里、怎样采取适当行动摧毁入侵的物质,而不会伤害人体其他细胞。任何药物也无法取代人体内与生俱来的、兼具防御和修复双重功能的免疫系统。   认识我们的免疫系统 免疫系统最重要的功能是清除体内各种垃圾。举个例子,红细胞的寿命只有120天,之后,就会死去变成垃圾,这就需要自身的免疫系统把它清除。   第二大功能,就是抵御疾病。科学家认为,免疫功能是获得健康的一把钥匙。当垃圾里产生蚊子时,蚊子就会到处飞,但是如果没有垃圾的话,它是无法繁殖下去的。换言之,病毒、细菌或肮脏的东西侵入人体,如果人的抵抗能力强,它就没有办法繁殖下去。   我曾受邀于美国最大的一个医学研究机构。在和科学家们一起讨论的时候,得到一个统一的结论,99%的疾病都和免疫系统失调有关。当然有的疾病和免疫系统疾病无关,如基因、遗传类的疾病。以前,我们对免疫学没有这么重视,一直认为还是化学药物的作用比较强,治病效果比较明显。有人会说,既然免疫系统这样强,为什么还要用化学药品呢?事实上,免疫系统的功能本身是很强的,但正是由于化学药品的副作用而使免疫系统的功能下降。 我曾经做过10年的癌症研究,看到许多被医生宣布只有两三个星期可以活的病人,过了几年以后,又回来找我们,奇妙的是,我们居然已经发现不到任何癌细胞的存在。这种药物无法治愈的疾病,我们的自身免疫系统却会将其治愈,这就证明,自身的免疫力是比化学药品要强的。   过去,我们没有认识到化学药品的副作用会那么大。到了如今,美国医学会不得不警告所有医学人员:医生的责任不在于开药单,而在于其指导的职责,他有责任告诉病人药品进入人体后,会有什么样的功能,会带来什么样的副作用。90%的感冒是由病毒引起的,但人们往往习惯向医生索要仅有抗菌作用的抗生素。所以美国医学会发出通知,医生不可以随意给病人开抗生素,除非已做过实验检查,证实其感冒是由细菌引起的。医生如果违反这一规定的话,其行医资格可能被吊销。   据美国医学统计报告, 美国每年有960万人因为服用化学药品而必须住院;每年有2.8万人因服用一种心脏病药而死于心脏病;每年有3300人因为吃了治关节炎的药物而死亡(而原来人们想不出关节炎和死亡有什么关系);每年有16.3万人因药物的副作用而导致大脑记忆力衰退;有3.8万人得了老年痴呆症;有2.8万人因药品而导致骨质疏松症。总而言之,这个统计结果还是非常保守的,有很多医院不在调查之列,实际情况只会更为严重。 从微观角度来看免疫系统,自身的免疫系统就像一个军队,里面有空军、海军、陆军各类军人,一旦有敌人侵入身体,就会将其消灭掉。   在免疫系统里几个最重要的器官 骨髓生产各类血细胞。从骨髓里产生的细胞,会被送到胸腺里。胸腺就像一个训练营,儿童时期,没有训练出足够的军队,所以很容易胸腺肿大。当人慢慢长大以后,训练出一批“军人”后,胸腺慢慢萎缩下来,但并不表示它没有功能了。 扁桃腺也是免疫系统的一部分,不应轻意地被割掉。   脾脏里面有很多V细胞,产生各类抗体。当人感冒或小孩注射疫苗以后,脾脏会稍微地肿大,这是很自然的现象,它是在拼命地生成武器来抵御外来的敌人。 淋巴就像一个过滤器,将所有的敌人集中起来,然后免疫细胞就会将其消灭。所以,感冒时淋巴摸起来会硬硬的,这说明身体里的免疫系统正在打仗,感冒过后,就会自然而然软下去了。   盲肠是免疫系统很重要的一部分,抵抗下腹部各种各样的感染。 血液里的白细胞都是免疫细胞。白细胞分为两大类,第一类称为T细胞,另一类称为V细胞。V细胞功能在于产生各种抗体,而这相当于军队里的武器、子弹。有战争,就会有死亡的军人,就必须将死亡的细胞清除。这就需要依赖我们胸腺训练出来的一批细胞。    对“死亡之吻”的研究 我在研究癌症的过程中,并没有发现任何的药物、化疗、电疗能够真正治疗癌症。 化疗只是赌博,成功率在1%左右,用作化疗的药品无法识别哪一个细胞是癌细胞,哪一个细胞是身体里的好细胞。所以我最终放弃研究这些化学药品,而转向研究免疫细胞中一个被称为“死亡之吻”的细胞。这个细胞一接触癌细胞,癌细胞就破裂了,被消灭掉了。   免疫学是一门非常年轻的科学,是有待研究的科学。没有任何一种化学药物能够代替免疫系统,也不可以用化学药物来刺激免疫系统,否则可能会造成各种副作用。既然不能用化学药品来提升免疫系统,那么只能依靠“营养”。   免疫器官对人体至关重要 免疫学是一门新学科。在美国,我是第一批的免疫学家,在这之前根本就没有人学习免疫学,对免疫的了解仅限于各种疫苗而已。但如今免疫学已经变成一门很受重视的学科了。举几个例子,在1960年以前,我们甚至不知道胸腺的功能,认为胸腺是一个没有用的器官。而根据后来的跟踪调查发现,所有胸腺被毁的人都得了癌症,因为他们丧失了最重要的免疫器官;现在很多人认为扁桃体没有用,就把它割了;有些人在做手术时,顺便将盲肠割掉了,认为可以预防盲肠炎。可是您知道吗?盲肠是由免疫细胞充塞而成的,能够抵抗各类的感染。如果有人认为可以用摘掉某些器官的方法来预防疾病的话,那么是否可以用割掉心脏的方法来预防心脏病呢?实际上,如果您的免疫系统不工作的话,您只有24小时可以活。   营养来自于完整的食物 谈到营养,每一个人对营养的定义是不一样的。我有一位很要好的女朋友,她每天给她的儿子两个鸡蛋,两个鸡腿,两杯牛奶,如果儿子没有吃下这些东西,她会很着急。我问她,为什么要给孩子吃这么多肉类呢?她说,因为孩子身体不好,别人一感冒,他就感冒,别人一咳嗽,他就咳嗽。我对她说,肉类并不代表营养。当人们吃到很多肉类,身体里就会产生荷尔蒙,整个免疫系统就会下降。 在美国,以前小学里有一个食品金字塔量表,它把最重要的营养划为肉类、牛奶制品,如今,这个量表已经被禁用了。研究发现这种教导导致今天美国各种癌症、心脏病不断地上升。   关于牛奶的问题。牛奶和人奶是完全不一样的蛋白质,人类只能消化50%的牛奶蛋白质,消化吸收90%的母奶蛋白质。有一部分人喝牛奶会肚子痛,喝母奶则不,因为其蛋白质不同。一只小牛生下来以后大约90磅,而两年以后大约成长到1000磅;人生下来是8磅,而十几年才成长到100多磅。换言之,我们是属于不同种类的,所需的营养也是不一样的。牛奶里含有很多的荷尔蒙,它可以刺激小牛快速地成长,但这种荷尔蒙到孩子身体里面,会产生不同的效果。 现在已有研究表明,牛奶会阻止小孩大脑的发育。   关于咖啡的问题。两种咖啡,一种没有咖啡因,一种有,喝哪一种好呢?不要多喝有咖啡因的咖啡,因为它会加速中枢神经系统的刺激,也有实验报告表明,它会制造皱纹;但是没有咖啡因的咖啡更不能喝,因为将咖啡因从咖啡中提取出来需要一种化学药品,而这种药品是致癌药品,美国卫生局已禁止使用了。所以,问题并不在于咖啡因的好坏,而在于咖啡因是如何被提取的。同理,我们不是说维生素不好,而关键在于维生素是如何提取出来的。   维生素与营养的关系 芬兰政府曾做过一个世界最大的维生素实验,可以说是比较公正的实验,出资4300万美元,总共2.9万人参与被试,长达5-8年时间。分为两组,一组是吸烟的人,让他们每天吃维生素A和维生素E;另外一组的人员什么都没有吃。过了5年、8年,吃维生素A和维生素E的这组人员死于癌症的比例要比另一组高出18%。更重要的一点,吃维生素E的人得心脏病、死于心脏病的人要高出另一组50%。当科学家听到这个消息的时候,真是很羞愧。一直以来,所有科研工作者在小型实验里面得到的结论,都是维生素E可以防止血管硬化,防止心脏病,这么大的实验,为什么会得出一个相反结论呢? 美国的卫生局研究报告表明,当维生素C存在于橘子等整体时,被称为抗氧化剂,能防止心脏病、癌症。当维生素C离开橘子后,能制造上亿的自由基,相反会造成心脏病、癌症。对于这个问题,我把它看得很简单。我认为,橘子是自然生成的,维生素C是人造的,人造的不可能比自然的要好。我们根本没有能力创造一个橘子或蕃茄出来。蕃茄里面含有一万多种营养素,这些营养素是什么我们都还搞不清楚,哪里来的智慧和权力对大众说,里面最重要的是维生素呢? 所以一个完整的食品才代表着真正的营养。   美国卫生局希望把所有的维生素制品列为药品,不让人们随意在市场上买到。服用维生素不当会带来很多副作用。美国有3万多儿童,因服用维生素而出现中毒的现象。小孩吃下过量的维生素,血液里的铁质就会上升,就比较容易得癌症;过食维生素E会造成关节炎;过食维生素D会造成肝功能的损伤。 结论 一个人经过化疗,免疫系统需要一年的时间才能恢复正常,但给他比较有营养的植物的话,免疫系统6个月以后就恢复正常了。 一系列的研究报告表明,免疫系统和植物营养是分不开的。   人的健康不是一天就会得到,疾病也是一样。要得癌症也很不容易, 人体里必须有100多种错误,才会产生一个癌细胞。 我们的生命就像一棵小树,需要精心地浇灌、呵护才会茁壮起来。这里,我谈三点重要的结论: 第一,营养。完整的植物,多种类的植物,代表着营养。人如果比较喜欢吃蔬果,少吃肉类,就会比较健康。美国现在提倡素食的汉堡,就是这个道理。第二,保持一种很平静的心情。因为一旦有压力或生气、紧张,半小时以内身体免疫功能就会下降。第三,适当的运动和休息。很激烈的运动对身体是绝对没有好处的。奥林匹克的运动模式是自我牺牲的一种表现。适当地休息,免疫系统在白天会比较弱一点,晚上的时候才做修补工作。举个例子,两个学生一个在读书,一个在睡觉,旁边有人咳嗽,哪个有可能被感染呢?当然是那个读书的人。   所以, 如果能做到这三点,我相信就算是不能活到120岁,也能活到110岁。 我希望大家都能把这样的智慧带给自己的亲戚、朋友,共同创造一个更美好,更健康的明天。 本文作者为陈昭妃博士,著名美国华裔科学家,“营养免疫学”的创始人。1997年,她荣获“美国十大杰出青年奖”,是59年来首位获此殊荣的华人,也是获此奖项唯一的女性。
个人分类: 科技转贴|4514 次阅读|8 个评论

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